En este tipo de micorrizas, el micelio fúngico del hongo micorrizógeno no forma el tejido en forma de fieltro que rodea los extremos de la raíz, sino que sus hifas penetran en el interior de las células epidérmicas a través de un pelo absorvente y, desde allí, van invadiendo las células colaterales.
Este tipo de micorrizzas son producidas básicamente por hongos del tipo Endogone, en ocasiones llamado Rhizophagus, y muestra poca especificidad en la elección de macrosimbionte, y la razón estriba en que hay poca respuesta morfogenética por parte de este último. En este caso, las diferentes sustancias nutritivas aportadas por el hongollegan hasta el interior de las células radicales del hospedante y, de forma ocasional, las células del macrosimbionte pueden llegar a digerir al hongo para aprovechar sus albuminoides. Un ejemplo macrosimbiontes de este tipo de micorrizas pueden ser; juníperos, arces, tejos...
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